El rubidio es un metal alcalino relativamente raro, con una concentración media aproximada de 90 partes por millón en la corteza terrestre, por lo que es más abundante que el litio, pero menos común que otros metales alcalinos como el sodio y el potasio. El elemento nunca se encuentra como metal libre en la naturaleza debido a su reactividad extrema con el agua y el oxígeno; en cambio, aparece formando compuestos en diversos minerales y formaciones geológicas. El rubidio sustituye habitualmente al potasio en los minerales que contienen potasio debido a sus radios iónicos y propiedades químicas similares, aunque en concentraciones mucho menores. La lepidolita, una mica que contiene litio, presenta las concentraciones de rubidio más elevadas que se encuentran en la naturaleza; algunas muestras contienen hasta un 3 % de óxido de rubidio. La polucita, un mineral de silicato de cesio y aluminio, también contiene cantidades importantes de rubidio, que sustituye al cesio en la estructura cristalina. La carnalita, un mineral de cloruro de potasio y magnesio presente en depósitos evaporíticos, contiene cantidades traza de rubidio que se acumulan durante la formación del mineral. El agua de mar contiene concentraciones muy bajas de rubidio, aproximadamente 0,12 partes por millón, lo que hace inviable económicamente su extracción oceánica pese al enorme volumen de los océanos. Las salmueras de lagos salados, especialmente las que tienen un alto contenido de potasio, pueden contener concentraciones elevadas de rubidio y representan una posible fuente de extracción comercial. Algunos minerales arcillosos y feldespatos contienen rubidio como elemento traza, aunque estas fuentes no son económicamente viables para producir rubidio. El elemento también se encuentra en pequeñas cantidades en algunas rocas ígneas, especialmente en formaciones de granito y pegmatita, donde se concentra durante las etapas finales de la cristalización. La mayor parte del rubidio comercial se obtiene como subproducto de la producción de litio a partir de lepidolita o como subproducto de la extracción de cesio de la polucita. La distribución geográfica de los recursos de rubidio está estrechamente vinculada a los depósitos de litio y cesio, con fuentes importantes en Canadá, Zimbabue y algunas zonas de Estados Unidos.